明治维新后，日本迎来新时代。传说中的刽子手拔刀斋绯村剑心，曾以“人斩”之名令人闻风丧胆，如今却立下不杀之誓，手持逆刃刀四处流浪。在东京的神谷道场，他遇到了继承父亲“活人剑”理念的神谷薰，并卷入了一场围绕“最强”之名的阴谋。神秘剑客雪代缘的出现，揭开了剑心过去的伤疤，一场围绕信念与救赎的战斗就此展开。剑心必须在守护眼前之人的同时，直面自己血腥的过去，寻找真正的“剑之道”。