《虚构推理第二季》延续了前作的故事，讲述了被称为“智慧之神”的少女岩永琴子与能看见妖怪的青年樱川九郎继续解决各种怪异事件的故事。本季中，两人将面对更加复杂离奇的案件，琴子运用其独特的“虚构推理”能力，通过编织合理的谎言来解释超自然现象，从而平息妖怪引发的骚乱。剧情在保持悬疑与推理元素的同时，深入探讨了人物之间的关系与成长，展现了现实与虚构之间的微妙平衡。